بیماریهای واگیر
برنامه کشوری ایمن سازی وبیماریهای قابل پیشگیری با واکسن
برنامه مراقبت از عوارض ناخواسته ایمن سازی AEFI
برنامه کنترل سل واستراتژی درمان تحت نظارت مستقیم DOTS
برنامه ریشه کنی فلج شل حاد
برنامه کشوری حذف جذام
برنامه کشوری حذف سرخک
برنامه کشوری حذف سرخجه
برنامه کشوری حذف سرخجه مادر زادی
برنامه کشوری حذف کزاز نوزادی
برنامه کشوری کنترل هپاتیت منتقله از خون
برنامه کشوری کنترل سیاه سرفه
برنامه کشوری کنترل دیفتری
برنامه ایدز وبیماریهای آمیزشی وبیماریهای رفتاری
برنامه مراقبت بهداشتی زندان ها و ندامتگاهها
برنامه کشوری نظام مراقبت و کنترل عفونت بیمارستانی
برنامه کشوری نظام مراقبت و کنترل بوتولیسم
برنامه کشوری نظام مراقبت و کنترل فاسیولیازیس
برنامه کشوری نظام مراقبت و کنترل بیماریهای منتقله از آب و غذا (طغیانهاOUTBREAKS )
برنامه کشوری نظام مراقبت و کنترل بیماریهای حاد تنفسی
برنامه کشوری نظام مراقبت و کنترل بیماری انفلوانزا
برنامه کشوری نظام مراقبت و کنترل روده ای با اولویت التور
برنامه کشوری نظام مراقبت و کنترل بیماری اسهال خونی
برنامه کشوری نظام مراقبت سندرومیک
برنامه مراقبتی مسمومیتهای ناشی از آب وغذا و غیره
برنامه بیماری تیفوئید
ثبت گزارش های تلفنی بیماریهای گزارش شده بطور مستمر و روزانه
نظارت بر اجرای برنامه بیماریهای انگلی
برنامه حذف بیماری مالاریا ( پروژه گلوبال فاند)
برنامه کشوری مراقبت و کنترل بیماری مننژیت
برنامه کشوری مراقبت و کنترل بیماری تب دنگ
برنامه کشوری مراقبت و کنترل بیماری پدیکلوزیس
برنامه کشوری مراقبت و کنترل بیماریهای مشترک انسان دام( حیوان گــزیدگی، هاری، لپتوسپیروز، تب مالت، سیاه زخم، سالک، کیست هیداتیک، CCHF، ....)
بیماریهای غیرواگیر
برنامه کشوری ثبت سرطان
برنامه کشوری نظام مراقبت بیماری فشارخون
برنامه کشوری بیماریهای قلبی عروقی
برنامه کشوری نظام مراقبت عوامل خطر بیماریهای غیر واگیر
برنامه کشوری بیماری بتا تالاسمی ماژور
برنامه کشوری بیماری پی کی یو(PKU)
برنامه کشوری ژنتیک اجتماعی
برنامه کشوری دیابت
برنامه غربالگری کم کاری تیروئید نوزادن
برنامه ثبت حوادث
برنامه ثبت غرق شدگی
برنامه مار و عقرب گزیدگی
اجرای برنامه های آموزشی
باز آموزی و نو آموزی